En Yécora predomina la selva baja caducifolia, en combinacion con bosques de coníferas y pináceas, especies como tepeguaje colorín, pochote y chupandía; y en segundo, pinos, oyamel, pin piñón, encino, palo blanco y madroño. En el municipio se encuentran las siguientes especies de animales: anfibios: sapos,rana platanera, sapo verde y siboli. Reptiles: tortuga verde de río, iguana de palo y culebra ranera. Mamiferos: murciélago, ratón de campo, ocelote, puerco espín, conejo y lince. Aves: tecolote, cornudo, garrapatero, etc.